Согласен, это разные службы: пограничник смотрит паспорт и визу, а таможня уже про багаж и декларацию. По себе помню: выходишь из самолёта, сначала паспортный контроль, потом получаешь чемодан и только после этого попадаешь в таможенную зону. Их легко перепутать, если летаешь редко, но по факту это два разных этапа.